Rong Shi, Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique
Je suis un professeur agrégé au Département de biochimie, microbiologie et bio-informatique (Faculté des sciences et de génie) à l’Université Laval. Je suis aussi affilié à l’Institut de biologie intégrative et des systèmes (IBIS). En tant que biochimiste et cristallographe des protéines, je suis intéressé par l’élucidation des mécanismes moléculaires des protéines au niveau atomique.
Les protéines sont de petites machines dans la cellule qui exécutent pratiquement tous les processus biologiques significatifs. La fonction d’une protéine dépend de façon critique de sa structure, i.e., de l’arrangement spatial de tous les atomes dans cette protéine. Une vue rapprochée de leur structure 3D peut aider à répondre aux questions fondamentales sur leurs rôles dans les cellules et la façon dont ces rôles sont exécutés. Utilisant la cristallographie aux rayons X comme méthodologie primaire en combinaison avec d’autres approches, mon laboratoire se concentre sur les études structurales et fonctionnelles d’une variété de protéines.
Les projets en cours incluent:
- Des enzymes impliquées dans la biosynthèse d’antibiotiques d’importance clinique et d’autres produits naturels à bio-activités prometteuses. Ces recherches vont aider à comprendre les mécanismes par lesquels ces molécules bioactives sont adaptées par une variété d’enzymes pour conférer la bio-activité observée et fournir la base structurale pour biosynthétiser des nouveaux analogues avec des propriétés améliorées.
- Des enzymes impliquées dans la voie du mévalonate et dans la biosynthèse de l’hormone juvénile d’insectes. Ces recherches vont fournir une meilleure compréhension de leurs caractéristiques uniques et faciliter le design d’inhibiteur à partir de leur structure, ouvrant ainsi la voie pour le développement de pesticides sélectifs respectueux de l’environnement et importants pour la protection des forêts.
- Les protéines de phage. Ces recherches visent à résoudre la dernière boîte noire existante en génomique des phages et à offrir beaucoup de potentiels pour une meilleure solution afin de surmonter les impacts négatifs des phages dans l’industrie laitière et fromagère.
- Nouveaux facteurs de virulence chez Pseudomonas aeruginosa, le deuxième pathogène humain opportuniste le plus important en clinique. L’élucidation de la structure et de la fonction de ces protéines va fournir de nouvelles connaissances requises pour comprendre la physiologie de cet important pathogène.
Notre recherche actuelle est supportée par CRSNG, FCI, FRQNT, PROTEO et l’Université Laval.