Transfert de fichiers
# Transfert de fichiers
Cette section traite du transfert de fichiers vers ou depuis les serveurs IBIS. Le point de départ ou
l’arrivée des fichiers à transférer peut être votre ordinateur personnel ou un autre ordinateur
serveur. Dans ce dernier cas, il pourrait s’agir d’un serveur de réseau de Calcul Canada.
## Transfert de fichiers à l’aide de la commande Unix de copie sécurisée ##
Cette commande est à utiliser en mode ligne de commande avec une fenêtre de terminal.
Il peut être exécuté à partir de votre ordinateur pour mettre vos données dans votre compte serveur, de cette façon nous disons que
vous poussez votre fichier. Assurez-vous que la commande scp est installée sur votre ordinateur.
L’autre méthode est effectuée à partir du serveur pour extraire votre fichier de votre ordinateur. Voyons comment cela peut être fait:
### Première option, poussez le fichier sur le serveur ###
1. Ouvrez le terminal et déplacez-vous vers l’endroit où vous avez votre fichier à transférer
2. Entrez la commande:
« scp votre_login@manitou.ibis.ulaval.ca: « «
Il est très important de mettre le « : » à la fin.
Comme vous pouvez le voir, vous pouvez vous arrêter après le « : « , dans ce cas le fichier se placera directement chez vous.
Si vous le souhaitez, vous pouvez écrire un chemin plus précis pour placer le fichier:
3. « « scp votre_login@manitou.ibis.ulaval.ca: / home / login / dossier1 / dossier2 / « `
### Deuxième option, extraire le fichier du serveur ###
1. Ouvrez le terminal et déplacez-vous vers l’endroit où vous souhaitez placer le fichier
2. Entrez la commande:
« `scp your_login@manitou.ibis.ulaval.ca: ~ / chemin / fichier. »
Le dernier point « .« ` indique que vous voulez mettre là où vous êtes réellement. Vous pouvez remplacer
le point avec un chemin si vous voulez:
« `scp your_login@manitou.ibis.ulaval.ca: ~ / chemin / fichier / home / login / dossier1 / dossier2« `
### Troisième option, transfert depuis le serveur ###
1. Ouvrez le terminal et connectez-vous à votre compte serveur
2. Déplacez-vous vers l’endroit où se trouve le fichier à transférer
3. Entrez la commande:
« `fichier scp your_login @ your_computer_adress: ~ / path / files« `
## Transférer des fichiers avec Globus ##
Cette application peut être très utile si vous avez beaucoup de données à transférer. Ça peut être
significativement plus rapide que scp et vous permet également de laisser la tâche s’exécuter en arrière-plan
à l’aide de l’interface Web.
Pour utiliser Globus, vous avez besoin d’un compte Globus et les deux serveurs finaux doivent être enregistrés auprès de Globus.
1. Pour utiliser Globus, allez sur [GlobusApp] (https://app.globus.org) et cliquez sur « Globus ID pour signer
in « et utilisez votre identifiant GlobusID pour vous connecter.
2. Si vous n’avez pas de compte, vous pouvez en ouvrir un en accédant à [GlobusID] (https://www.globusid.org/)
3. Une fois le compte créé, retournez sur [GlobusApp] (https://app.globus.org) et cliquez sur
«Identifiant Globus pour vous connecter» et utilisez votre identifiant GlobusID pour vous connecter.
4. Une fois dans Globus, recherchez « pdbi » dans Collection pour trouver la plateforme Bio-Informatics. Un
l’authentification sur manitou vous sera alors demandée puis vous accéderez au répertoire
/projet/
5. Sélectionnez les fichiers à transférer
[Retour aux sujets] (https://bitbucket.org/jerlar73/ibis_bioinfo/wiki#home)